虽然益生菌对动物机体有诸多好处，但是由于微生态制剂品种繁多，生产所需菌种各异，产品功能各不相同，产品质量参差不齐，令广大养殖户难以作出准确的选择和判断。面对众多的微生态制剂产品，如何正确合理地去选择它呢？
首先要了解其生产工艺问题和加工处理技术。
芽孢杆菌、乳酸菌、酵母菌等不同菌种对环境因素的耐受力不同，所以要保证其进入动物体内作用时的活性是个首要问题。
其次看微生态制剂能否在肠道定植及菌种能否产生消化酶及代谢产物的多少，活菌数的添加量是否足够，还有产品的稳定性问题。
微生态制剂产品要能耐受饲料调质、制粒、温度破坏，要耐受胃酸的破坏，因而还要了解其是否具备稳定化处理工艺，如包埋、微胶囊处理及其真空包装等后续处理。
第三还要看是否效果及菌种的特异性问题
实际上使用微生态制剂就是充分调动动物本身的潜能，提高饲料的可利用程度，从而在提高动物的生产性能或降低饲料成本上获得效益。 天园牧业生产的益生菌经过重重培植、选育，多能够能够耐酸、耐胆盐，耐高温，如：植物乳杆菌，其菌耐酸、耐胆盐、粘附力强，对常见致病菌有较强抑制力；戊糖片球菌，耐酸、耐胆盐、对温度有较好耐受力，粘附力强。天园牧业微生态制剂使用益生菌的发酵生产采用国内先进的气体环流式全自动液态三级发酵罐，进行单菌种发酵，然后根据不同动物的需求进行复配。芽孢杆菌发酵液采用喷雾干燥法处理，不仅保证了芽孢的活性，还保存了有益代谢产物消化酶、维生素、有机酸等。天园牧业乳酸菌的生产采用国家948项目引进技术——真空冷冻干燥工艺，对其进行双层微胶囊包被，解决了乳酸菌不易存活的难题，大大延长了保存期，显著提高了使用效果。
1 应有针对性
在使用微生态制剂的同时要充分考虑到其作用对象以及目的，对不同的动物，不同的生长阶段要区别对待，不同种类的动物消化系统的特点不同,根据动物种类应选择适宜的微生态制剂产品。
2微生态制剂的活性与施用剂量
微生态制剂的活性是最重要的，其中必须含有一定数量的活菌，但保存中的活菌率很不稳定,因此产品在出厂时应保证有足够的活菌数，以使其在规定储存期内能够发挥良好的作用,为提高微生态制剂的稳定性，很多厂家都进行了加工处理技术，以保证产品活菌数的稳定性。
3 施用时间
微生态制剂在动物的整个生长过程都可以使用，但不同的生长时期其作用效果不尽相同。一般在动物幼体，体内微生态平衡尚未完全建立，抵抗疾病的能力较弱，此时使用微生态制剂，可较快地进入体内，占据附着点，形成优势菌群，效果最佳，另外在断奶、运输、饲料转变，天气突变和饲养环境恶劣等应激条件下，动物体内微生态平衡遭到破坏，使用微生态制剂对形成优势菌群极为有利，因此，掌握应用时机，尽早并长期饲喂微生态制剂产品，益生作用才能得到充分体现。
4避免或慎重选择与抗生素的配合使用
由于微生态制剂是活菌制剂，而抗生素具有杀菌作用，因此一般情况下二者不可同时使用。在动物发病期，可选用针对性较强的抗生素杀灭或抑制病原微生物的繁殖，控制疾病的蔓延，但抗生素在杀死致病菌的同时，动物体内的正常菌群也遭到破坏，此时应及时引入微生态制剂，通过其独特的益生作用，使紊乱的肠道菌群平衡得到恢复，微生态制剂与抗生素具有协同互补的作用，为避免耐药菌株的泛滥，耐药益生菌株尽量不要和抗生素合用，致使细菌产生耐药性。
5微生态制剂与疫苗的协同作用
微生态制剂可以非特异性的增强机体对疫苗的反映，提高免疫效果，微生态制剂的使用与否对于提高疫苗效果有主要作用，微生态制剂具有增强机体的特异性和非特异性免疫功能，可起到有病治病，无病防病，具安全无副作用的目的。
